В интервью журналу Empire Картер признался, что у него уже есть идеи для нового фильма, который в отличие от ленты «Секретные материалы: Хочу верить», вернется к мифологии оригинального сериала. Кроме того, Джиллиан Андерсон и Дэвид Духовны уже давно готовы вернуться к своим звездным ролям агентов Скалли и Малдера.

Крис Картер также рассказал о вводе нового героя в исполнении Саймона Пегга в триквел:

«Мы планировали позвать его во второй фильм, но тогда для него не нашлось роли. Поэтому, если нам дадут зеленый свет, то Саймон Пегг, непременно, появится в «Секретных материалах 3»».